营养钵的制作也可以分三个阶段：
第一阶段是营养土的配制。一般而言，要选择疏松、肥沃、易保水保肥、无病菌、无杂草种子的土壤表土2份，腐熟的有机肥1份掺匀配比。每立方米营养土加过磷酸钙1公斤，营养土按比例掺匀调好后过筛，遇天晴时充分暴晒杀菌。按最常用的直径11厘米、高10到12厘米的标准钵计算，一般每钵需营养土6-7两，营养土的配制除满足制钵外，还需要预留制体土量的2到3成做盖籽土用。
第二个阶段就是营养土的消毒。方法很简单，就是制钵前用福尔马林或多菌灵100倍液等杀菌剂对土喷细雾，并加盖薄膜密闭2-3天消毒杀菌。
第三个阶段就是制造钵，生产上最常用的既有自己做纸袋灌制，也有商品钵可供装土，营养土消毒杀菌后，等药味散尽即可装土入钵。一般就西瓜而言营养钵不宜过小，一般直径10厘米以上高10-12厘米，也不用过大，以省工节本。装土时掌握营养土的湿度，以手捏成团、落地即散为原则。钵底部捣实，以免松动易散，而钵上部则需要轻轻镇压，做到下紧上松，以利种子出苗。
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